Сколько помню, св.пр. Паисий Святогорец как раз одобрял личную, келейную молитву за самоубийц. Потому что мы не знаем, в каком состоянии человек это совершил. Но молитва должна приносить душевный мир - если она этого не делает, то наверное стоит пообщаться с более старшим и опытным духовно человеком - например, священником того храма, в который Вы ходите.
Если человек действительно был душевно болен - тут бы Вы ничего не сделали, Вы не врач, а психологические болезни очень сложны.